Manga Pokemon Special yang dibuat oleh komikus bernama Hidenori Kusaka, Nintendo ini bercerita tentang Petualangan Pokemon mengikuti kisah game Game Boy asli, dengan semua Gym Leader, tempat, dan lawan. Ada banyak aksi saat para pelatih ini menjelajahi hutan, rimba, kota, dan gua untuk mencari Pokémon dan berpetualang… terkadang bekerja sama, terkadang sendiri-sendiri! Tapi bisakah mereka menggagalkan skema Team Rocket, sekelompok penjahat misterius yang ingin menggunakan Pokémon untuk kejahatan?